本會與日本公益財團法人交流協會已於本（2015）年11月25日至26日，假東京大倉大飯店舉行「第40屆臺日經濟貿易會議」。本項會議自1976年首度召開以來，本年是第40屆舉行，臺日雙方藉由本項會議之召開，不斷強化經濟貿易合作關係。
本次會議我方代表團由本會李會長嘉進擔任團長；日本代表團由交流協會大橋光夫會長擔任團長，會議共計63項議題，其中臺方29題、日方34題，分成一般政策組、農林水產‧醫藥‧技術交流組、智慧財產組等3組會談，會中雙方就經濟貿易等全般議題廣泛交換意見，並達成許多共識，雙方會長於閉幕式中簽署議事錄，作為執行依據，並預定於明（2016）年6、7月間，就執行情形進行追蹤檢討。
會後，兩會會長簽署「臺日避免所得稅雙重課稅及防杜逃稅協定」、「臺日競爭法適用瞭解備忘錄」及「臺日強化災害防救業務交流合作備忘錄」等3項協定及備忘錄，重要內容如下：
一、「避免雙重課稅協定」
（一）就所得來源地的課稅限制、稅賦問題的解決、稅務上的合作關係等予以規範，協定之目的在於促進雙方投資往來、深化雙方經貿交流及提升企業競爭力。
（二）具體內容：
1.臺日間支付的所得，在來源地的稅率分別為股利10%、利息10%、權利金10%。
2.建立解決適用租稅協定爭議的架構。
3.為使臺日間稅務行政有效執行，建立相關資訊交換機制。
二、「競爭法適用備忘錄」
（一）就適用競爭法時之相互執法通知、協調、資訊交換、諮商等加以規範，本備忘錄之目的在於促進臺日間競爭法之有效執行。
（二）本備忘錄於11月26日生效。
三、「災防交流合作備忘錄」
（一）分享臺日間之災害經驗及對策等資訊及心得，並明文規定每年進行意見交流。
（二）透過本備忘錄之實施，期盼臺日得以進一步加強防災業務之合作。
過去40多年來，我國與日本共簽署61項協議，其中有28項協議是馬總統2008年上任以來迄今所簽署的，舉其重要者包括2011年的「開放天空」、「青年度假打工協議」、「臺日投資協議」及2013年的「臺日漁業協議」等協議。本會李會長自2013年5月就任以來，亦已與日本交流協會大橋會長簽署了14項協定及備忘錄。
本會李會長致詞時表示，我與日本近年來所發展出特別夥伴關係，已有前述多項簽署之協議等具體成果，期待臺日經貿合作能早日堆上最後一塊積木簽署「經濟夥伴協議」。未來只要對雙方人民有益，本會與日本交流協會都會克服萬難，為臺日雙方更近一步合作關係持續努力。